的的喀喀湖富鱼产和飞禽，湖中鱼虾众多，岛上水鸟麋集。湖中的鱼类主要有两种鱂（山鱂属〔Orestias〕，　一种带有黑带或黑色条纹的小鱼）和一种鮎鱼（毛鼻鮎属〔Trichomycterus〕）。1939年及其后，引入了鱒鱼。还有一种大蛙　（Telmatobius属）栖息在湖边较浅的地区，大的有将近1呎长。